فرونشست آسیب جدی به دیوارهها، گنبد و سقف مسجد سید اصفهان زد. بهرام نادی، عضو کارگروه تخصصی فرونشست اصفهان گفت: ترکهای سازهای مسجد سید ناشی از فرونشست را نباید در نبود متولی مسجد جست و جو کرد و این ترکها ناشی از نبود متولی در بخش کنترل و مدیریت منابع آب سطحی و زیرزمینی است. مرمت بنای مسجد سید بدون کنترل منابع آب زیرزمینی، ناپایدار خواهد بود و وقوع و بروز مجدد ترک و آسیبهای سازهای و غیر سازهای دور از انتظار نیست.