وزارت دفاع و پشتیبانی نیروهای مسلح نیز با صدور بیانیهای، تأکید کرد: آماده مجازات سخت و عبرتآموز اسرائیل هستیم.
وزارت دفاع در بیانیه خود آورده است: در این اقدام وحشیانه و مغایر با تمامی قوانین بینالمللی، جمعی از غیرنظامیان بیگناه، از جمله زنان و کودکان، تعدادی از فرماندهان نیروهای مسلح و دانشمندان این مرز و بوم به شهادت رسیدند و این رژیم کودککش ذات خبیث خود را بیش از پیش آشکار نمود.
ارتش جمهوری اسلامی نیز در بیانیهای با محکومیت تجاوز رژیم صهیونی اعلام کرد: یقیناً مسببان و حاضران در این توطئه از این پس روی آرامش را نخواهند دید.
در این بیانیه تأکید شده است: «ارتش جمهوری اسلامی ایران با محکوم نمودن این جنایت آشکار و خبیثانه رژیم صهیونی، شهادت فرماندهان ولایتمدار و شهدای غدیر، سردار سپهبد شهید محمد باقری رئیس ستادکل نیروهای مسلح، سردار سپهبد شهید غلامعلی رشید فرمانده قرارگاه مرکزی خاتم الانبیا(ص)، سردار سپهبد شهید حسین سلامی فرماندهکل سپاه پاسداران انقلاب اسلامی و دانشمندان هستهای کشور را پس از عمری تلاش و مجاهدت، تبریک و تسلیت میگوید و اعلام میدارد؛ دست قدرتمند نیروهای مسلح جمهوری اسلامی ایران رژیم صهیونی را رها نخواهد کرد و سرنوشت محتوم این رژیم خونریز و کودککش، دردناک و کوبنده خواهد بود.»