جدایی نکونام بعد از آنکه باشگاه استقلال خواستار حضورش در بازی با السد قطر شده، منتفی شد و جانشین این مربی قرار است بعد از بازی با السد قطر معرفی شود. سرمربی آبی ها در حالی که پنجشنبه نامه خداحافظی از هواداران را منتشر کرده بود، پس از اولتیماتوم باشگاه در آخرین تمرین استقلال در زمین شماره دو آزادی حاضر شد تا با تیم به قطر برود.در عین حال نکونام تاکنون هیچ نامه رسمی دال بر اینکه قصد داشته باشد به طور قطعی مربیگری در این باشگاه را کنار بگذارد، به باشگاه ارائه نکرده است و همین موضوع نیز سبب شده تا مدیران باشگاه استقلال از این مربی بخواهند بازی با السد قطر را نیز پشت‌سر بگذارد؛ هرچند که ارائه نشدن نامه رسمی خداحافظی نیز نمی‌تواند دلیلی بر ادامه همکاری قطعی باشد و به همین دلیل با وجود ماندگار شدن این مربی تا بعد از بازی با السد، همچنان شایعه برکناری‌اش به گوش می‌رسد. در همین راستا برخی مسئولان استقلال باب مذاکره با سرمربی خارجی را باز کرده‌اند تا بلافاصله بعد از بازی با السد اقدامات لازم را در این راستا انجام دهند.نام استراماچونی نیز در میان گزینه‌های مورد نظر به گوش می‌رسد، اما این مربی قطعاً به استقلال بازنخواهد گشت و مدیران باشگاه گزینه دیگری را به جای او در این سمت قرار خواهند داد. اینکه نام گزینه مورد نظر باشگاه استقلال چیست، به درستی مشخص نشده است، اما در روز‌های آتی نام سرمربی جدید استقلال برای هواداران این باشگاه روشن خواهد شد.هواداران نیز با انتشار نظرات خود در فضای مجازی خواستار جذب یک مربی بزرگ خارجی شده‌اند.در واقع هواداران استقلال دیگر خواهان حضور مربیان ایرانی در کادرفنی تیم خود نیستند و بشدت خواهان استخدام مربی بزرگ خارجی هستند تا شاید اوضاع را به نفع خود تغییر دهند. حال باید دید با وجود بازگشت نکونام به محل تمرین در روزهای آتی مدیران استقلال چه گزینه‌ای را به عنوان سرمربی معرفی خواهند کرد. زمزمه حضور ساپینتو نیز در استقلال به گوش می‌رسد که خبر قابل توجهی است.
نامه‌ای که جواد نکونام در رسانه‌ها به عنوان نامه خداحافظی از استقلال منتشر کرد، نشان داد او از برخی عوامل پشت‌پرده این باشگاه بشدت ناراحت است. او در نامه خود چنین نوشته است:
هوادار بدان، دشمنان این تیم درون استقلال هستند؛ از همان دورانی که بازی می‌کردم و سال‌ها بازوبند کاپیتانی پاس را به بازو می‌بستم، همه فوتبالیست‌ها می‌دانستند که چقدر به استقلال عشق و تعصب دارم و چقدر استقلالی هستم. من از دوران کودکی استقلالی بودم و رؤیای این را داشتم که یک روز پیراهن این تیم را بر تن کنم. حتی به عشق سرمربیگری در استقلال مسیر مربیگری را آغاز کردم و همیشه عشق و تلاشم برای موفقیت در این تیم بوده است.
در زمان بازیگری در تیم اوساسونا این تیم را رها کردم تا در دوران اوج پیراهن استقلال را بر تن کنم و قهرمانی با این تیم نقطه عطف کارنامه فوتبالم شد. من همان زمانی هم که پیراهن استقلال را بر تن کردم و گل قهرمانی را زدم، تمام تلاشم را برای خشنودی و شادی دل هوادار می‌کردم.
پارسال هم تا لحظه آخر جنگیدم و با همه ناملایمات و دشمنی‌هایی که بود، تلاش کردم و تیم را با ٦٧ امتیاز قهرمان کردم، از این جهت می‌گویم قهرمان که تمام سیستم فوتبال از جمله رئیس فدراسیون فوتبال به این موضوع اذعان کردند که گل حریف آفساید بود و این حق استقلال بود که قهرمان شود و از ما عذرخواهی کردند.
سال گذشته هم فقط برای شادی دل هوادار، تلاشم را کردم، چون خودم از جنس هوادار هستم و درد دل آنها را می‌دانم، امسال هم سعی خود را کردم و تا لحظه آخر جنگیدم، با سه نفر تمرین را شروع کردیم و همه ناملایمات و سنگ‌اندازی‌ها را پشت‌سر گذاشتیم با این حال تیم بزرگی را بستیم که در آینده حرف‌های زیادی برای گفتن خواهد داشت هرچند با من این اجازه را ندادند.
نمی‌خواهم بهانه بیاورم و فقط درد دل می‌کنم، خودتان ببینید در همین ۲۰ روز گذشته چه اتفاقاتی افتاد! کجای دنیا بعد از یک باخت شایعه برکناری سرمربی یک تیم را علم می‌کنند! می‌دانید که چه کسانی را اجیر کردند که تمرکز استقلال و بازیکنان و کادرفنی‌اش و از همه مهم‌تر جواد نکونام را به هم بریزند. به نظر شما تیمی که تمرکز نداشته باشد، می‌تواند موفق شود؟ از همان موقع بحث اولتیماتوم را راه انداختند، اما بهتر بود صادقانه حرف دلشان را می‌زدند. در نهایت هم استقلال و هوادارش امروز لطمه خورده است.
همیشه از دور می‌دیدم که دارند چه بلایی سر استقلال می‌آورند، اما امروز خودم در متن کار قرار دارم و با پوست و گوشت و استخوانم همه دشمنی‌ها، حاشیه‌سازی‌ها، چوب لای چرخ گذاشتن‌ها و سنگ‌اندازی‌ها را امسال در استقلال بیشتر از همیشه حس کردم و تازه متوجه شدم چه کسانی و چرا نمی‌خواهند این تیم هیچ‌وقت موفق شود!
هوادار استقلال بداند رقیب استقلال در درون استقلال است و شاید کسانی هم باشند که از بیرون برای ناکامی استقلال قدم برداشته و اقدام کنند که این هم یک امر طبیعی است، اما ما امسال از درون استقلال ناکام شدیم!
*هرچند که باشگاه استقلال با این خداحافظی مخالفت و اعلام کرد او باید در بازی با السد هم به کارش ادامه دهد و تا این بازی موظف به هدایت استقلال است که نکونام این درخواست را قبول نکرد.