در پی انتخاب حضرت آیت‌الله سیدمجتبی خامنه‌ای به عنوان سومین رهبر انقلاب اسلامی ایران از سوی مجلس خبرگان رهبری، نهادهای نظامی و امنیتی کشور با صدور پیام‌ها و بیانیه‌هایی جداگانه، با رهبر جدید انقلاب بیعت کرده و بر تبعیت کامل از فرامین فرمانده کل قوا و استمرار راه امامین انقلاب تأکید کردند. این بیعت‌ها که از عالی‌ترین سطح فرماندهی نیروهای مسلح آغاز شد، نشان ‌دهنده انسجام و همبستگی ساختار دفاعی و امنیتی کشور در حمایت از رهبری جدید و ادامه مسیر انقلاب اسلامی بود. در نخستین واکنش‌ها، ستاد کل نیروهای مسلح جمهوری اسلامی ایران به همراه قرارگاه مرکزی خاتم‌الانبیا(ص) با صدور بیانیه‌ای، انتخاب آیت‌الله سید مجتبی خامنه‌ای را تبریک گفتند و ضمن تسلیت شهادت حضرت آیت‌الله العظمی امام خامنه‌ای(ره)، بر اطاعت کامل نیروهای مسلح از فرمانده کل قوا تأکید کردند. در این بیانیه آمده است: «نیروهای مسلح اعلام می‌دارند تحت فرامین و تدابیر منتخب مجلس خبرگان رهبری حضرت آیت‌الله سید مجتبی خامنه‌ای (مدظله‌العالی) به عنوان ولی فقیه، رهبر و فرمانده معظم کل قوا، مقتدرتر، باصلابت‌تر و جهادی‌تر از گذشته در حفظ دستاوردهای انقلاب اسلامی در صحنه خواهند بود و دشمنان امت اسلامی به ویژه آمریکا و دشمنان جنایتکار به عنوان رهبر نظام سلطه و استکبار جهانی را از تجاوز، تعدی و تعرض به مسلمانان و ملت غیرتمند و صبور، قدرشناس و مؤمن و انقلابی ایران پشیمان خواهند نمود و تا آخرین نفس و قطره خون تحت فرماندهی رهبر عزیزمان از منافع و امنیت کشور در مقابل توطئه‌های دشمنان اسلام و ایران عزیز مقاومت و ایستادگی خواهند کرد.»

 سپاه: در دفاع از جمهوری اسلامی
گام بر‌می‌داریم
پس از ستاد کل نیروهای مسلح، سپاه پاسداران انقلاب اسلامی نیز با انتشار بیانیه‌ای رسمی، انتخاب آیت‌الله سید مجتبی خامنه‌ای را «آغاز مرحله‌ای جدید در انقلاب اسلامی» توصیف و بر اطاعت کامل از ولی فقیه و فرمانده کل قوا تأکید کرد. در این بیانیه، سپاه پاسداران خود را «سرباز و بازوی مقتدر ولایت» دانسته و اعلام کرده است که «پاسداران انقلاب اسلامی با همه توان در مسیر حفظ ارزش‌های انقلاب اسلامی، صیانت از میراث گرانبهای امام خمینی(ره) و امام خامنه‌ای و دفاع از نظام جمهوری اسلامی ایران گام خواهند برداشت.» سپاه در این بیانیه همچنین از همه اقشار جامعه خواسته است که در این مقطع تاریخی با پشتیبانی از ولایت فقیه و نظام اسلامی، مسیر تحقق اهداف بلند انقلاب و شکل‌گیری تمدن نوین اسلامی را دنبال کنند.
 بیعت پاسداران نیروی دریایی
علاوه بر این بیانیه رسمی، بخش‌های مختلف سپاه پاسداران نیز پیام‌های جداگانه‌ای منتشر کردند. نیروی زمینی سپاه پاسداران انقلاب اسلامی در بیانیه‌ای انتخاب رهبر جدید را «موهبتی عظیم» توصیف کرد و اعلام داشت «فرماندهان و رزمندگان این نیرو با عزم و صلابتی بیش از گذشته تحت تدابیر رهبر انقلاب در مسیر پاسداری از انقلاب اسلامی، دفاع از استقلال و اقتدار کشور و مقابله با دشمنان آمریکایی و صهیونیستی آماده جانفشانی هستند.» نیروی قدس سپاه پاسداران انقلاب اسلامی نیز با انتشار بیانیه‌ای اعلام کرد: «رزمندگان جبهه مقاومت در سراسر منطقه با رهبر جدید انقلاب اسلامی بیعت کرده‌اند و همچنان با همه توان در برابر ظلم ایستاده و از مظلومان دفاع خواهند کرد.» از سوی دیگر، فرمانده نیروی دریایی سپاه پاسداران انقلاب اسلامی نیز با اعلام بیعت پاسداران این نیرو با سومین رهبر انقلاب تأکید کرد که «دریادلان سپاه با ایمان راسخ و عشق به ولایت در مسیر اطاعت از ولی فقیه حرکت خواهند کرد.»
 
موج سی‌ام عملیات وعده صادق همزمان با اعلام نام رهبر جدید انقلاب
همچنین سردار سید مجید موسوی فرمانده نیروی هوافضای سپاه در پیامی در شبکه اجتماعی، خطاب به رهبر جدید انقلاب نوشت: «اگر کوه‌ها را بخواهی تا همراهت به میدان نبرد روانه شوند، من آنها را به حرکت درمی‌آورم. دستت را بگشا تا با تو بیعت کنم؛ بیعتی که تا آستانه شمشیر بر گردن نیز بر آن استوار بمانم.»
نیروی هوافضای سپاه همچنین موج سی‌ام عملیات وعده صادق۴ را همزمان با اعلام رهبری رهبر معظم انقلاب، با رمز مبارک «علی ولی الله» علیه پایگاه‌های تروریست‌های آمریکا در منطقه و شمال سرزمین‌های‌های اشغالی با موشک‌های سوخت مایع و جامد خرمشهر، فتاح، خیبر، قدر و پهپادهای راهبردی به صورت صد درصد موفقیت‌آمیز به اجرا درآورد.
 
ارتش: گوش به فرمان فرمانده هستیم
پس از سپاه پاسداران، ارتش جمهوری اسلامی ایران نیز در پیامی رسمی، انتخاب آیت‌الله سید مجتبی خامنه‌ای را تبریک گفت و با ایشان بیعت کرد. در پیام ارتش آمده است که «ارتش جمهوری اسلامی ایران به عنوان «ذوالفقار ولایت» با رهبر جدید انقلاب عهد می‌بندد که همچون دوران پرافتخار انقلاب اسلامی تا آخرین نفس در راه حفظ آرمان‌های انقلاب، امام خمینی(ره) و رهبر شهید انقلاب جانفشانی کند.» ارتش همچنین تأکید کرده است که «در مأموریت مقدس دفاع از استقلال، تمامیت ارضی و امنیت کشور، قوی‌تر از گذشته گوش به فرمان فرمانده کل قوا خواهد بود.»
 
تجدید عهد سربازان گمنام امام زمان 
با ولی فقیه
در حوزه امنیتی نیز، وزارت اطلاعات با صدور اطلاعیه‌ای به قلم حجت‌الاسلام سید اسماعیل خطیب وزیر اطلاعات، بیعت «سربازان گمنام امام زمان(عج)» با رهبر جدید انقلاب اسلامی را اعلام کرد. در این پیام آمده است که «جامعه اطلاعاتی کشور با تجدید عهد با امامین انقلاب، تبعیت کامل خود از اوامر و رهنمودهای رهبر جدید انقلاب اسلامی را اعلام کرده و آمادگی خود را برای انجام مأموریت‌های خطیر امنیتی در مسیر اعتلای نظام اسلامی ابراز می‌کند.» سازمان اطلاعات سپاه نیز با صدور بیانیه‌ای بیعت خود با رهبر سوم انقلاب اسلامی را اعلام و خطاب به آیت‌الله سید مجتبی خامنه‌ای اعلام کرد: «سربازان گمنام امام زمان(عج) در سپاه پاسداران تا آخرین قطره خون خود در پاسداری از امنیت انقلاب اسلامی در داخل کشور، توسعه مرزهای امنیتی ایران و بر هم زدن نقشه‌های ضدامنیتی دشمنان، لحظه‌ای فروگذار نکرده و مطیع اوامر جناب‌عالی خواهند بود.»
 
فراجا: آماده اجرای فرامین رهبری هستیم
در ادامه این موج بیعت‌ها، فرماندهی کل انتظامی جمهوری اسلامی ایران نیز با صدور بیانیه‌ای، انتخاب رهبر جدید انقلاب اسلامی را تبریک گفت و اعلام کرد که «نیروهای انتظامی کشور همچون گذشته گوش به فرمان فرمانده کل قوا بوده و برای اجرای فرامین ایشان تا پای جان آماده‌اند.»
 
بیعت بسیج با رهبر جدید انقلاب
همچنین سازمان بسیج مستضعفین در بیانیه‌ای جداگانه با ولی‌امر مسلمین جهان آیت‌الله سید مجتبی خامنه‌ای بیعت و بر استمرار راه انقلاب اسلامی و آمادگی بسیجیان برای دفاع از ارزش‌ها و آرمان‌های نظام تأکید کرد.