اسماعیل بقایی، سخنگوی وزارت امور خارجه در تشریح مواضع ایران نسبت به تحولات اخیر قفقاز جنوبی گفت: «جمهوری اسلامی ایران با دقت کامل این تحولات را رصد می‌کند و هیچ موضوعی را ساده‌سازی یا کوچک‌نمایی نخواهد کرد.»
وی در گفت‌وگویی رادیویی با اشاره به اهمیت ژئوپلیتیک و اقتصادی قفقاز جنوبی برای ایران و کشورهای منطقه از جمله روسیه تأکید کرد: «انتشار تفسیرها و اخبار نادرست می‌تواند روابط ایران با کشورهای این حوزه را تحت‌تأثیر قرار دهد و باید از سوءبرداشت‌ها جلوگیری شود.»
بقایی درباره مسأله مرزهای ارمنستان تصریح کرد: «ایران این موضوع را با حساسیت دنبال می‌کند و معتقد است رفع انسداد مرزی ارمنستان باید با دقت بررسی شود. او همچنین یادآور شد که در جریان جنگ اخیر ارمنستان و آذربایجان، مسیر ریلی جنوب ارمنستان مسدود شده بود.»
سخنگوی وزارت خارجه با تأکید بر اینکه مداخلات خارجی خط قرمز ایران است، افزود: «حضور نیروهای فرامنطقه‌ای در قفقاز نه تنها مفید نیست، بلکه باعث پیچیدگی‌های ژئوپلیتیک خواهد شد.» به گفته او، مقامات ارمنستان نیز اطمینان داده‌اند که بازسازی مسیر ریلی با مشارکت شرکت‌های داخلی و یک شرکت آمریکایی ثبت‌شده در ارمنستان انجام می‌شود و هیچ نیروی خارجی در امتداد مرزها مستقر نخواهد شد. بقایی با اشاره به ماده ۱۲ موافقتنامه صلح ارمنستان و آذربایجان یادآور شد: «طبق این ماده، استقرار نیروهای نظامی خارجی در مرزهای دو کشور ممنوع است و خود ارمنستان نیز نسبت به تبعات چنین حضوری آگاه است.» او در پایان تأکید کرد: «ثبات و امنیت قفقاز جنوبی برای ایران اهمیت ویژه‌ای دارد و جمهوری اسلامی آماده است برای گسترش همکاری‌های دوجانبه و حمایت از اقدامات تقویت‌کننده ثبات منطقه گام بردارد.