توضیحات دانشگاه شهید بهشتی درباره قطع همکاری با فاضلی
پس از طرح موضوع قطع همکاری دانشگاه شهید بهشتی با محمد فاضلی در برنامه میزگرد فرهنگی پزشکیان که این برنامه را دستخوش حاشیه کرد و موجب بروز رفتارهای ناشایست از سوی مشاور مسعود پزشکیان شد، دانشگاه شهید بهشتی توضیحاتی را در ارتباط با قطع همکاری فاضلی ارائه داد.  دانشگاه شهید بهشتی در اطلاعیه خود اعلام کرد: «آقای دکتر محمد فاضلی پس از قطع همکاری از سوی دانشگاه مازندران، تقاضای همکاری با دانشگاه شهید بهشتی داشتند که به رغم مخالفت هیأت اجرایی جذب و با توجه به فضای ایجاد شده برای مسئولان وقت دانشگاه، از تاریخ 1/۶/۱۳۹۳ همکاری خود به عنوان عضو هیأت علمی را با این دانشگاه آغاز نمودند.»
این دانشگاه در ادامه اطلاعیه خود توضیح می‌دهد که «ایشان قبل از حضور در دانشگاه شهید بهشتی به عنوان معاون پژوهشی در مرکز بررسی‌های استراتژیک ریاست جمهوری و همزمان در  وزارت نیرو به‌عنوان مشاور مشغول به کار بوده‌اند که در بدو حضور در دانشکده و در جلسه مصاحبه صلاحیت عمومی به ایشان متذکر شدند که حضور تمام‌وقت از شرایط پذیرفتن عضو هیأت علمی در دانشگاه است و به ایشان در خصوص انصراف از سمت معاونت و ادامه فعالیت در آن مرکز تأکید شد و دکتر فاضلی ضمن پذیرش شرط فوق‌الذکر متعهد شدند از سمت خود استعفا داده و از مرکز منفک خواهند شد و به صورت تمام‌وقت در دانشگاه حضور خواهند داشت، ولی به‌رغم این تعهدات و تذکرات بعدی به فعالیت‌های اجرایی خود در آن مرکز و سایر سازمان‌ها ادامه دادند.» طبق اعلام دانشگاه شهید بهشتی، نهایتاً پرونده در جلسه شهریورماه 1400 هیأت اجرایی جذب دانشگاه، مورد بررسی قرار گرفت و این هیأت ضمن بررسی سوابق و شرایط عدم پایبندی ایشان به تعهدات اخلاقی و کاری و نداشتن احساس مسئولیت به عنوان عضو هیأت علمی در قبال دانشگاه و همچنین نادیده گرفتن ضوابط و مقررات آیین‌نامه استخدامی اعضای هیأت علمی، محمد فاضلی را فاقد شرایط ادامه همکاری با دانشگاه دانست.